Die Abteilung MNA fungiert als gesetzliche Vertretung (Beistandschaft) sowie als psychosoziale Interessensvertretung. Im Detail bedeutet dies, dass die Abteilung MNA sämtliche gesetzliche Funktionen übernimmt, welche üblicherweise von den Eltern ausgeübt werden. Sie begleiten, beraten und unterstützen die Jugendlichen bis zu deren Volljährigkeit in verschiedensten Lebensbereichen, um ihre Interessen und ihr Wohl sicherzustellen.

MNA, die dem erweiterten Asylverfahren im Kanton Zürich zugewiesen werden, werden durch die Abteilung MNA im Asylverfahren rechtlich vertreten. Dies gilt auch für MNA ohne geregelten Aufenthalt im Kanton Zürich. So wird sichergestellt, dass die Kinder und Jugendlichen in asyl- und ausländerrechtlichen Belangen von einer rechtskundigen Person ihres Vertrauens unterstützt und so ihre Interessen gewahrt werden.

Der Abteilung MNA obliegt eine Triagefunktion in diversen Belangen. Dazu gehören beispielsweise die Suche nach einer adäquaten Tagesstruktur oder Wohnform. Dazu gehört zudem die Koordination und Zusammenarbeit mit Behörden, Schulen, stationären Institutionen, dem Gesundheitssektor und weiteren Akteurinnen und Akteuren.

Die Abteilung MNA unterstützt die Kinder und Jugendlichen in der Förderung ihrer Ressourcen wie beispielsweise der schulischen oder beruflichen Ausbildung, welche den Fähigkeiten und Ressourcen der MNA entspricht.

Die Abteilung MNA fungiert zudem als Kompetenzzentrum im Spezialgebiet MNA. Aufgrund ihrer langjährigen und breiten Erfahrung im Spezialgebiet der unbegleiteten Minderjährigen, wird die Abteilung MNA von verschiedenen Ämtern, Gemeinden, Kantonen, und dem Bund sowie zahlreichen Behörden und Organisationen für die Beratungen im Bereich MNA regelmässig beigezogen. Immer wieder berät die Abteilung MNA auch Organisationen aus dem europäischen Raum.